口袋妖怪火红作为经典重制作品，保留了初代151只精灵的完整图鉴，玩家可通过野外捕捉、剧情赠送、特殊事件等方式组建多样化的队伍。初始阶段可从大木研究所选择妙蛙种子、小火龙或杰尼龟作为首位伙伴，三者分别具备草/毒、火、水属性，进化后最终形态均拥有超过500的种族值，是通关流程的核心战力。游戏内精灵分布遵循栖息地逻辑，例如常磐森林聚集绿毛虫、独角虫等虫系精灵，月见山则出没超能系皮皮和岩石系小拳石。
急冻鸟位于双子岛深处，需推动岩石阻断水流才能抵达；闪电鸟栖息在无人发电厂最底层；火焰鸟则镇守灯火山顶。超梦作为版本终极神兽，需在华蓝洞窟最深处挑战，该区域要求队伍掌握冲浪和攀瀑技能。剧情限定精灵包括正辉赠送的伊布、枯叶市码头获得的拉普拉斯，以及通过化石复活系统二选一的化石盔或菊石兽，这些精灵均具备独特的战术价值。
水系精灵在火红版本中占据重要地位，除初始杰尼龟外，华蓝市道馆附近水域可钓到鲤鱼王，进化后暴鲤龙拥有极高物理攻击；月见山入口的鲤鱼王商人虽需500金币，但进化后同样实用。玛瑙水母在多数海域均有分布，进化后的毒刺水母是优秀的特防盾牌。特殊垂钓点如彩虹市右侧池塘，使用高级钓竿可获取迷你龙，其最终形态快龙是准传说级战力。
虫系与飞行系精灵因成长快速成为前期优选。绿毛虫12级进化为巴大蝶后，复眼特性配合催眠粉能有效控制对手；波波最终进化型比雕拥有稳定输出能力。尼比市道馆前建议捕获派拉斯，其孢子特性可干扰岩石系敌人。稀有精灵如皮卡丘虽在常磐森林出现率仅5%，但电系技能对水系道馆有显著克制效果。
完成七之岛剧情后，1号岛灯火山温泉区出现卡蒂狗，进化风速狗后火系输出强劲；3号岛森林能遭遇雪拉比，但需完成特定任务。通信进化类精灵如胡地、耿鬼需联机交换，而勇吉拉与鬼斯通在野生原野区可直接捕获。大师球建议保留给超梦或急冻鸟，其他稀有精灵可使用高级球配合状态异常提高捕获率。
