关卡是玩家推进游戏进程、体验剧情和获取成长资源的核心途径。游戏内的关卡并非一个固定不变的数字，而是版本更新与玩法扩展不断丰富的体系。其主体框架沿袭了西游记的经典故事脉络，玩家将从花果山启程，依次经历三打白骨精、火焰山、斗败黄眉怪等一系列耳熟能详的剧情挑战，这些经典剧情关卡构成了游戏的主线推进骨架。玩家等级提升和解锁新区域，后续还会接触到更多基于神话传说改编的关卡场景，为玩家的取经之路铺设了层层挑战。
除了贯穿始终的主线剧情关卡，迷你西游还设计了多样化的特殊挑战关卡以丰富游戏体验。这其中就包括难度较高的特殊挑战，考验玩家的阵容搭配与策略深度；以及需要多人协作共同讨伐强大敌人的世界BOSS战，这类关卡更强调玩家间的配合。玩家之间进行实时对抗的竞技场，也为游戏增添了纯粹的PVP关卡乐趣。这些不同类型的关卡共同构建了一个立体而多元的挑战环境，使得关卡的概念超越了单纯的推图，涵盖了玩家在游戏中可能参与的各类挑战性玩法。
关卡的推进与玩家的资源获取息息相关。游戏在玩家达到11级时会开启探索功能，玩家可以消耗体力对已通关的关卡进行反复探索，从而稳定获取道行经验、银两以及各种装备、法术书和护法卡牌等资源。在东海湾、地府、玉兔村等不同的关卡区域，会掉落特定星级的护法卡牌、装备和法术，这些掉落物是玩家培养护法、提升战力的重要来源。重复挑战并探索特定关卡，成为玩家日常游戏和养成角色的关键环节。
在游戏的中后期，玩家会遇到难度显著提升的高阶关卡。例如游戏内设有荡妖玩法，其中的精英妖窟关卡（如第6、7图）怪物阵容配置复杂，对玩家队伍的综合实力提出更高要求。后续的关卡挑战，如第9图，更是需要玩家精心打磨队伍的生存与输出能力才能通过。这些高难度关卡不仅是对玩家阵容深度的终极考验，也常常是获取高级别卡牌和稀有材料的重要场所，激励着玩家不断优化自己的护法组合与战术策略。
关于游戏精确的关卡总数，公开的攻略资料并未提供一个恒定的数字。这主要是因为作为一款持续运营的网络游戏，其关卡内容会通过版本更新进行增加和调整。游戏设计了大量的副本，其总数量时间推移而不断扩充。对于玩家而言，关注当前版本下的关卡挑战内容和通关策略，比纠结于一个固定的总数更为实际。官方会通过活动和新版本持续注入新的关卡挑战，保持游戏内容的新鲜感和玩家的探索欲望。
